吉林农业大学是我国首批具有学士、硕士学位授予权的高等院校之一，是吉林省省属院校中最早获得博士学位授权及博士后科研流动站资格的高等院校。学校本科专业涵盖农、理、工、医、文、管理、法、经济、艺术等九个门类，硕士学位授权学科涵盖农、理、工、医、管理、法、教育等七个门类，博士学位授权学科涵盖农、理、工、医、管理等五大门类。现有博士学位授权一级学科9个，博士学位授权二级学科43个，硕士学位授权一级学科18个，硕士学位授权二级学科81个，博士后科研流动站7个，专业学位授权类别7种（21个领域）。现有国家重点（培育）学科1个、部委级重点学科3个，吉林省高校重中之重立项建设一级学科4个，吉林省高校“十二五”优势特色重点立项建设学科10个。    

学科成员中具有高级专业技术职称733人，博士生导师104人，硕士生导师719人，形成了以中国工程院院士、国务院学科评议组成员、国家级有突出贡献中青年专家、全国优秀教师为代表、结构合理、素质优良、充满活力的高水平师资队伍。学校现有小麦和玉米深加工国家工程实验室、人参新品种选育与开发国家地方联合工程研究中心、科技部食用菌新种质资源创制国际联合研究中心、动物生产及产品质量安全教育部重点实验室、农业部参茸产品质量安全风险评估实验室等10个国家和部委级科研平台，33个省级重点科研平台，各类实践教学基地373个。通过学科交叉融合，创新研发出一大批突破性成果，并在一些领域处于国内外领先水平。